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微生物（细菌）是引发牙周炎的始动因子。堆积在牙与牙龈交界处的牙面和牙龈沟内的菌斑微生物及其产物引发牙龈的炎症和肿胀，使局部微生态环境更利于一些牙周致病菌滋生，由牙龈上向龈下扩延。它们所引起的炎症范围扩大到深部组织，导致牙周组织的破坏。凡是能加重菌斑滞留的因素，如牙石、不良修复体、食物嵌塞（塞牙）、牙排列不齐、解剖形态的异常等，均可成为牙周炎的局部促进因素，加重和加速牙周炎的进展。
牙周炎是多因素疾病，某些全身性疾病如糖尿病等也会对牙周炎有负面影响。目前认为没有哪种全身性疾病或功能紊乱会直接导致慢性牙周炎的发生。此外，某些环境因素和行为因素如吸烟、精神压力等可能是危险因素。近年来发现遗传背景也可能与慢性牙周炎有关。
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