在口腔感染的诊断中，检查病原体指标对于明确病因、指导治疗至关重要。以下是需要重点检查的几类病原体指标。

细菌方面，口腔是一个复杂的微生态环境，存在着大量细菌，当菌群失调或机体抵抗力下降时，就可能引发感染。常见的需检查的细菌指标包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。比如金黄色葡萄球菌，它是引起口腔颌面部化脓性感染的常见病原菌之一，检查其相关指标，如通过细菌培养鉴定其是否存在，对于判断是否为该菌感染导致的口腔脓肿等疾病有重要意义。还有链球菌，可引发牙周炎、扁桃体炎等口腔疾病，通过检测其抗原、抗体等指标，有助于明确感染情况。另外，革兰氏阴性菌中的大肠杆菌、铜绿假单胞菌等也可能导致口腔感染，检测它们的特定毒素、耐药基因等指标，对于制定针对性的治疗方案很关键。

真菌也是口腔感染中需要关注的病原体。白色念珠菌是口腔真菌感染最常见的病原菌，多见于免疫力低下人群，如艾滋病患者、长期使用抗生素或糖皮质激素的患者。检查白色念珠菌可以通过直接涂片镜检，观察有无菌丝和孢子，也可以进行真菌培养，确定是否为该菌感染以及其对不同抗真菌药物的敏感性。此外，新型隐球菌等真菌也可能引起口腔感染，检测其特异性抗原等指标有助于早期诊断。

病毒同样会引起口腔感染。单纯疱疹病毒是常见的引起口腔黏膜疱疹的病原体，检测其特异性的IgM、IgG抗体，能够判断是近期感染还是既往感染。人乳头瘤病毒与口腔黏膜的疣状病变、口腔癌等疾病有关，检测其核酸等指标，对于疾病的诊断和病情评估有重要价值。此外，EB病毒也可能与口腔淋巴组织的病变相关，检测其相关抗原、抗体等指标，有助于明确感染情况。

总之，在口腔感染的诊断中，全面检查细菌、真菌、病毒等各类病原体指标，对于准确诊断病因、合理选择治疗药物、提高治疗效果具有重要意义。