抗原抗体结合的基础是基于分子间的特异性识别和相互作用。这种结合主要依靠非共价力，包括静电引力、氢键、范德华力以及疏水作用等。抗原上的特定区域（称为表位或决定簇）与抗体的可变区（特别是互补决定区，即CDR区）之间存在高度的结构互补性和亲和性，使得两者能够紧密结合。这种结合具有高特异性，意味着一种抗体通常只与其对应的抗原发生反应，这是免疫系统识别并清除外来物质的关键机制之一。在临床检验中，利用这一原理可以进行各种免疫学检测，如ELISA、免疫荧光等，用于疾病的诊断和监测。
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