在实验室中，初步鉴定沙门菌通常会经历以下几个步骤：
1. 样本采集与处理 首先需要从疑似感染部位（如粪便、血液或尿液等）收集样本。之后将样本接种到选择性培养基上，比如SS琼脂（Salmonella-Shigella Agar）或是XLD琼脂（Xylose-Lysine-Dextrose Agar）。这些培养基能够抑制非目标细菌的生长，同时让沙门菌显现出特有的颜色变化或形态特征。
2. 观察菌落特征 在选择性平板上孵育18-24小时后，观察形成的菌落。沙门菌通常会产生无色至淡黄色、圆形、光滑湿润且边缘整齐的小菌落，并可能伴有黑色中心（特别是在XLD琼脂上）。
3. 生化试验 从疑似为沙门菌的菌落挑取单个菌落进行一系列生化测试，以进一步确认其身份。常见的生化反应包括：
   - IMViC试验：确定细菌对葡萄糖、乳糖等碳源利用情况以及产酸产气能力。
   - 靛基质试验：检测细菌能否分解色氨酸产生靛基质。
   - 硫化氢试验：检查细菌是否能将含硫氨基酸转化为H2S气体，沙门菌通常呈阳性反应。
   - 尿素酶试验：评估细菌分解尿素的能力。

4. 血清学鉴定 如果上述生化测试结果支持该菌株为沙门菌，则可进一步通过血清凝集实验来确定具体的血清型。使用已知的抗原-抗体对进行交叉反应，可以识别出特定的O、H和Vi抗原组合，从而精确地分类到不同的血清类型。

以上步骤是实验室初步鉴定沙门菌的基本流程，但最终确诊还需结合临床信息和其他辅助检查结果综合判断。