肠杆菌科是一大类革兰氏阴性杆菌，包括了很多重要的病原体。在临床实验室中，通过一系列生化反应和分子生物学方法可以有效地对这些细菌进行鉴别。下面简述几种常用的鉴别方法：
1. 生化试验：这是最传统的也是最基本的鉴定方法。通过观察细菌对特定底物的代谢情况来区分不同的菌属。例如：
   - 乳糖发酵试验：肠杆菌科中的一些菌属如大肠埃希菌、产气肠杆菌等能够分解乳糖产生酸和气体，而沙门氏菌、志贺氏菌则不能。
   - 靛基质试验（Indole test）: 某些细菌能将色氨酸代谢成靛基质，如大多数的大肠埃希菌为阳性，而伤寒杆菌等为阴性。
   - 硫化氢生成试验：某些细菌在含硫氨基酸的培养基中可产生硫化氢气体。例如沙门氏菌和志贺氏菌通常为阳性。
2. 血清学方法：利用特异性抗体与目标细菌表面抗原相结合来进行鉴定，如使用多价血清或单克隆抗体进行凝集试验等。
3. 分子生物学技术：
   - PCR（聚合酶链式反应）: 可以直接从临床样本中扩增特定的DNA序列来快速准确地识别病原体。
   - DNA测序：通过对16S rRNA基因或其他保守区域的测序，可以精确到种甚至亚种水平。

4. 自动化鉴定系统：如VITEK 2、BacT/ALERT等，这些仪器能够同时进行多种生化反应，并结合数据库自动给出鉴定结果。这种系统大大提高了工作效率和准确性。

在实际工作中，通常需要综合运用上述方法才能准确地鉴别出肠杆菌科的不同菌属。每种方法都有其适用范围和局限性，在具体操作时应根据实验室条件、样本类型以及所需达到的鉴定精度来选择合适的方法。