耶尔森菌感染的诊断主要依赖于病原学检查，包括细菌培养、血清学检测以及分子生物学方法。具体步骤如下：
1. 细菌培养：这是最直接也是最常用的方法。可以通过采集患者的血液、粪便、尿液或者脓肿等标本进行培养。耶尔森菌在普通营养琼脂上生长良好，24-48小时后可形成圆形、光滑、半透明的菌落。但值得注意的是，耶尔森假结核杆菌和鼠疫耶尔森菌需要在较低温度（约25℃）下才能更好地生长。
2. 血清学检测：对于难以从标本中分离出病原体的情况，可以采用血清学方法进行辅助诊断。常用的有凝集试验、酶联免疫吸附测定(ELISA)等，通过检测患者血清中的特异性抗体来判断是否感染了耶尔森菌。
3. 分子生物学技术：如PCR（聚合酶链反应）技术能够快速准确地鉴定出病原体DNA，对早期诊断和分型具有重要意义。此外，还可以利用基因芯片、测序等手段进一步研究其遗传特征及耐药性等问题。
4. 影像学检查和其他辅助检查：在某些情况下，如怀疑有腹膜炎或肠穿孔时，可能需要进行腹部X线片、B超或者CT扫描等影像学检查；对于疑似耶尔森菌引起的关节炎，则需做滑液分析。
5. 临床表现和流行病学史：结合患者的临床症状（例如发热、腹泻、腹痛等）以及是否有接触动物或食用未煮熟的肉类等情况，有助于提高诊断准确性。

综上所述，综合运用上述多种方法可以有效地对耶尔森菌感染进行诊断。在实际操作过程中，应根据具体情况选择合适的检测项目，并密切结合临床表现作出最终判断。