芽孢杆菌属的鉴别诊断需要综合多个方面进行判断，以下是具体的鉴别诊断方法。

首先是形态学特征。芽孢杆菌属为革兰阳性大杆菌，菌体两端呈方形，呈链状排列，无荚膜。在有氧条件下能形成芽孢，芽孢呈椭圆形，位于菌体中央或次极端，不大于菌体宽度。观察芽孢的位置、形态以及大小与菌体的关系，有助于初步判断是否为芽孢杆菌属。

其次是培养特性。芽孢杆菌属营养要求不高，在普通琼脂平板上生长良好，形成较大、扁平、灰白色、不透明、边缘不整齐的菌落，常呈“卷发状”。在血琼脂平板上，有些菌株可产生β溶血。在液体培养基中，呈均匀混浊生长，管底有絮状沉淀。通过观察不同培养基上的菌落形态和生长情况，可以进一步缩小鉴别范围。

再者是生化反应。芽孢杆菌属能分解多种糖类，产酸不产气，能液化明胶，还原硝酸盐，触酶阳性。不同种的芽孢杆菌在生化反应上存在差异，例如炭疽芽孢杆菌能分解葡萄糖、麦芽糖、蔗糖，不分解阿拉伯糖、木糖；而枯草芽孢杆菌能分解多种糖类，还能利用柠檬酸盐。通过一系列的生化试验，可以对芽孢杆菌属进行种的鉴别。

另外，血清学试验也很重要。可以采用特异性的抗血清进行凝集试验，检测细菌表面的抗原，以确定是否为芽孢杆菌属以及具体的种。

最后，分子生物学方法。近年来，PCR技术、16S rRNA基因测序等分子生物学方法在芽孢杆菌属的鉴别诊断中发挥着越来越重要的作用。这些方法具有快速、准确、灵敏等优点，能够从基因水平上对芽孢杆菌属进行准确的鉴别。

综上所述，芽孢杆菌属的鉴别诊断需要综合形态学、培养特性、生化反应、血清学试验和分子生物学方法等多个方面的结果，才能做出准确的判断。