衣原体镜检特征会因不同的镜检方法和衣原体发育阶段呈现出不同的表现。

在光学显微镜下，衣原体具有独特的形态特征。衣原体在宿主细胞内生长繁殖会经历原体和始体两个阶段。原体是衣原体的感染型，呈球形或椭圆形，直径约为0.2 - 0.4μm，普通光学显微镜下勉强可见，Giemsa染色呈紫色，Macchiavello染色呈红色。原体具有高度感染性，当它进入宿主细胞后，会逐渐增大并演变成始体。始体也叫网状体，是衣原体的繁殖型，体积较大，直径约0.5 - 1.0μm，呈圆形或椭圆形，Giemsa染色和Macchiavello染色均呈蓝色。在感染的细胞内，可见到始体以二分裂的方式繁殖，形成众多子代原体。

当使用电子显微镜观察时，能更清晰地看到衣原体的超微结构。原体有较致密而坚韧的细胞壁，中央有致密的类核结构。始体的细胞壁较薄而脆弱，无致密类核结构，内部可见纤细的网状结构。

在进行临床标本镜检时，还可观察到衣原体在细胞内形成的包涵体。包涵体是衣原体在细胞内繁殖过程中形成的一种特殊结构，不同种类的衣原体形成的包涵体形态、染色特性等有所差异。例如沙眼衣原体包涵体中含有糖原，碘染色可呈棕褐色，而鹦鹉热衣原体和肺炎衣原体的包涵体不含糖原，碘染色为阴性。通过观察包涵体的形态、大小、位置以及染色特性等，有助于对衣原体感染进行初步的鉴别诊断。

总之，衣原体镜检特征是诊断衣原体感染的重要依据，不同的镜检方法和观察角度能为临床诊断和研究提供丰富的信息。