先天性甲状腺功能减退症，也称为克汀病或先天性甲低，是一种由于新生儿甲状腺发育不良、缺如或者酶缺乏导致的甲状腺激素合成和分泌不足的情况。这种疾病在新生儿中的发生率大约为1/4000到1/6000，是儿童内分泌疾病中较为常见的一种。

该病的主要原因包括：
1. 甲状腺不发育或发育不良：这是最常见的原因，约占所有病例的85%左右。这种情况可能是由于遗传因素导致胚胎期甲状腺形成过程中的异常，如基因突变等。
2. 异位甲状腺：正常情况下，甲状腺位于颈部前方气管两侧，但如果在胎儿发育过程中迁移路径出现偏差，则可能导致甲状腺异位生长于其他部位，影响其功能。
3. 甲状腺激素合成障碍：某些酶的缺乏或活性降低可阻碍甲状腺激素的合成过程。例如，碘代谢异常、过氧化物酶缺陷等都可能引起此类问题。
4. 下丘脑-垂体轴功能障碍：下丘脑分泌促甲状腺释放激素（TRH），刺激垂体前叶产生并释放促甲状腺素（TSH）。如果这个调节机制出现问题，则可能导致甲状腺不能正常工作，从而引发先天性甲低。
5. 母亲因素：母亲在怀孕期间服用某些药物、自身免疫性疾病或者碘摄入过多或过少等也可能对胎儿的甲状腺功能造成影响。

早期诊断和及时治疗对于预防因先天性甲状腺功能减退症导致的智力发育迟缓和其他生长障碍至关重要。新生儿筛查计划是发现此病的有效手段之一，通过血液检测可以快速准确地识别出患病婴儿，并给予相应的干预措施。