光棘球海胆含磷脂，包括磷脂酰胆碱（phosphatidylcholine），磷脂酰乙醇胺（phosphatidylethanolamine），磷脂酰丝氨酸（phosphatidylserine），磷脂酸（phosphatidic acid），溶血磷脂酰乙醇胺（lysophosphatidylethanolamine），二磷脂酰甘油（diphosphatidylglycerol）；还含糖脂、糖部分，包括葡萄糖（glucose），半乳糖（galactose），木糖（xylose），鼠李糖（rhamnose），及1-O-乙基-D-葡萄糖（1-O-D-glucose）。此外，还含多羟基萘醌类：6-乙基-2，3，5，7，8-五羟基-1，4-萘醌（6-ethyl-2,3,5,7,8）A。

本品性腺含3种唾液糖脂（sialoglycolipids）的混合物，已分离出2种，分别为N-乙醇酰神经氨基-α-（2→4）-N-乙醇酰神经氨基-α-（2→6）-吡喃葡萄糖基-β-（1→1）-神经酰胺[N-glycolylneu raminyl-α(2→4)-N-glycoloylneuraminyl-α-(2→6)-glucopyramosyl-β（1→1）-ceramide]。还含17种氨基酸，较称定的有：天冬氨酸（aspartic acid），谷氨酸（glutamic acid），甘氨酸（glycine），赖氨酸（lysine）。卵母细胞在原生质阶段含糖原（glycogen），中性粘多糖（neutralmucopolysaccharide）。

肉中含醛缩酶（aldolase）。

过中含抗肿癌糖蛋白（glycoproteins）。

马粪海胆卵含海洋（卵）微管蛋白（marine egg tubulin）。蛋黄含水溶性脂肪蛋白，β-胡萝卜素（β-carotene）和海胆烯酮（echinenone）。

细雕刻肋海胆未受精卵含过氧化氢酶（catalase）。

性腺含角鲨烯（sgualene），正十七碳烯（n-heptadecene），正十七烷（n-heptadecane）。

卵含酸性磷酯酶（acid phosphatase）.