降钙素可引起恶心、呕吐、面部潮红、手部麻刺感。这些不良反应随着用药时间延长而减轻。其他副作用有皮疹、口中异味、腹痛、尿频和发抖。注射部位可能出现炎症反应。长期使用血中可产生抗体，一般并不影响疗效，对动物来源的降钙素产生耐受性后，合成人降钙素仍然有效。其他一些不良反应包括头痛、发冷、胸压迫感、虚弱、头昏、鼻塞、气短、眼痛和下肢浮肿等。应警惕由低血钙造成的四肢搐搦现象。由于本品为蛋白质，应考虑引起全身性过敏的可能性并作好相应的抢救准备。对怀疑过敏或有过敏史的病人在用鲑降钙素前应先做皮试（1：100稀释）。