与医学有关的细胞质内亚结构主要有核质、核蛋白体、质粒及胞质颗粒。
1.核质：或称拟核由裸露的双链DNA盘绕成松散的网状结构与RNA构成，无组蛋白包绕。它相当于细胞核的功能，决定细菌的生物学性状和遗传特征。
2.核蛋白体：或称核糖体每个细菌可含有万余个。它由占70%的RNA及占30%的蛋白质构成，是菌体蛋白质合成的场所。此外，链霉素和红霉素可与核蛋白体结合而起到抗菌作用医|学教育网搜集整理。
3.质粒：染色体外的遗传物质，存在于细胞质中。为闭合环状的双链DNA，带有遗传信息，控制细菌某些特定的遗传性状，如性菌毛生成、耐药性、细菌素产生、毒素形成等。质粒能自行复制，随细菌分裂转移到子代细胞中。质粒并非细菌生命活动所必需，细菌失去质粒仍能正常存活。质粒除决定细菌自身的某些性状外，还可通过接合或转导作用等，将有关性状传递给另一细菌。医学上主要的质粒有R质粒（耐药性质粒），F质粒（致育性质粒）和Vi质粒（毒力质粒）等。
4.胞质颗粒：为细菌贮存的营养物质多糖、脂类及多磷酸盐等。异染颗粒为白喉棒状杆菌、鼠疫杆菌和结核分枝杆菌等所特有的胞质颗粒，它由RNA和偏磷酸盐构成，美兰染色呈紫色。此着色特点用于鉴别诊断。
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