嘉南药理大学校徽：

嘉南药理科技大学目前台湾设有药学系的7所大专院校之一，也因为药学系之便，嘉药成为少数台湾私立科大中，能够吸引分数在大学升学考试属中高程度的普通高中生以及成绩在前5%的高职生就读的学校。

嘉南大学学校校徽：

一、 嘉南大学四字系‘嘉南药理科技大学’之简称医学教育|网搜集整理。

二、图中六角形图案系化学最基本之有机化合物“苯”，药物中有许多化合物由苯的衍生物合成而来，其意义乃指药及有关之科学。

三、校徽下方枝梅花及植物：梅花系中华民国国花，植物表示药用植物，中国传统药品乃是采用药用植物制成。其意义乃指“中国传统药品及其有关科学”。

四、象征该校将中国传统药学之优点，与西方进步之药学相结合，并加以发扬光大，以造福人群、社会。