河套学院院系设置：
据2015年5月学校官网显示，该校下设蒙古语言文学系、汉语言文学系、外国语言文学系、理学系、机电工程系、土木工程系、农学系、医学系、经济管理系、艺术系、马列教学部、体育教学部等12个教学单位，附设继续教育学院、中等职业技术学校和科兴驾校。
| 系部名称 | 本科专业 | 专科专业 | ||
|---|---|---|---|---|
| 理学系 | 数学与应用数学 | 信息与计算科学 | 计算机应用技术（电子商务） | |
| 应用化学 | 信息与计算科学（云计算） | 应用化工技术 | ||
| 艺术系 | 美术学 | 美术学（广告设计） | 学前教育 | 音乐教育（含航空服务） |
| 学前教育 | 音乐学 | 舞蹈表演 | 艺术设计 | |
| 农学系 | 动物科学 | 农学（设施农业） | 畜牧兽医 | 食品营养与检测 |
| 动物科学（蒙授） | ||||
| 医学系 | 护理学 | 康复治疗学 | 护理 | 康复治疗技术 |
| 助产 | ||||
| 经济管理系 | 财务管理 | 审计学 | 市场营销 | 人力资源管理 |
| 金融保险 | 会计电算化 | |||
| 机电工程系 | 电气工程及其自动化 | 电气自动化技术 | 汽车技术服务与营销 | |
| 供用电技术 | 印刷图文信息处理 | |||
| 自动化生产设备应用（媒体企业自动化） | ||||
| 土木工程系 | 农业水利工程 | 水利工程 | 道路桥梁工程技术 | |
| 建筑工程技术 | ||||
| 外国语言文学系 | 英语 | |||
| 汉语言文学系 | 新闻学 | 汉语言文学 | 语文教育 | 新闻采编与制作 |
| 蒙古语言文学系 | 中国少数民族语言文学（文秘） | 畜牧兽医（蒙授） | ||
| 体育教学部 | 体育教育（足球） | |||
|
中等职业技术学校
（五年制高职）
|
（河套学院就读） | 建筑工程施工 | 道路与桥梁工程施工 | |
| 会计电算化 | 电气运行与控制 | |||
| 学前教育 | 护理 | |||
| 音乐（航空服务） | 汽车整车与配件营销医学教|育网搜集整理 | |||
| 会计 | 电气技术应用 | |||
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