蒙医药是蒙古族人民在长期与疾病斗争中积累起来的一套具有民族特色的医疗体系。蒙药方剂配伍有其独特的理论和实践基础，主要体现在以下几个方面：
1. 五元学说：蒙医学认为宇宙万物都是由土、水、火、风、空五大元素构成的，人体健康与否取决于这五大元素是否平衡。因此，在配伍时会考虑药物对调节这些元素的作用。
2. 六基病理论：蒙医将疾病分为寒、热、湿、燥、虚、实六大类，称为“六基”。在组方时，医生会根据患者的具体病情（如属寒还是属热）来选择相应的药材进行配伍，以达到调和体内平衡的目的。
3. 药性理论：蒙医非常重视药物的四气五味及归经等特性。所谓四气即寒、热、温、凉；五味则是酸、苦、甘、辛、咸。在配方时会根据疾病的性质以及患者体质来选择具有不同气、味特点的药材，使之相互作用以增强疗效或减轻副作用。
4. 君臣佐使原则：蒙药方剂配伍同样遵循中医“君臣佐使”的理论，即每个处方中都有起主要治疗作用的主药（君），辅助加强君药效果或者针对其他症状的辅药（臣），以及调节药物之间关系、减轻不良反应的调和药或反佐药（佐）和引导药力直达病所的向导药（使）。
5. 重视整体观念：蒙医药强调人与自然环境之间的联系，治疗时不仅关注局部病变部位，更注重调整患者的整体状态。因此，在配伍时也会考虑到季节变化、地理环境等因素对疾病的影响。
6. 独特药材的应用：蒙古地区有着丰富的动植物资源，许多特有或稀有的草药被广泛应用于蒙医药中。这些药物往往具有特殊的功效，是其他体系所不具备的。

总之，蒙药方剂配伍是一个复杂而精细的过程，需要综合考虑多种因素来确保治疗效果的最大化和安全性。