在处理消化系统疾病的治疗时，中西医结合的方法可以发挥各自的优势，提高疗效。下面是一些关于中西药如何配合使用的建议：
1. 明确诊断：首先需要通过现代医学手段（如血液检查、胃镜等）对患者进行准确的诊断，了解具体的病因和病理变化。同时，中医师应根据四诊合参的方法，辨证施治。
2. 针对不同病症采取相应措施：
   - 对于功能性消化不良：可以采用西药调节胃肠动力（如多潘立酮），缓解症状；配合使用具有健脾益气、和胃止痛作用的中药方剂或单味药材。
   - 慢性胃炎、胃溃疡等器质性疾病：在医生指导下服用抑制胃酸分泌、保护胃黏膜的西药，同时辅以清热解毒、活血化瘀、养阴生津的中成药，如黄连上清丸、参苓白术散等。
   - 肠易激综合症（IBS）：可尝试使用抗抑郁药物或止泻剂减轻症状；结合疏肝理气、调和肠胃功能的中药治疗，比如逍遥散加减。
3. 注意药物相互作用：在联合用药时，需要特别关注中西药之间可能存在的配伍禁忌及其对肝脏代谢的影响。例如某些含有大黄成分的中药可能会增强抗凝血药物的效果；而一些活血化瘀类药物则可能与非甾体抗炎药产生不良反应。
4. 个体化治疗：每个患者的具体情况不同，因此在制定治疗方案时应充分考虑患者的年龄、性别、体质等因素，并根据病情的变化及时调整治疗计划。
5. 加强健康教育和生活方式指导：无论是采用哪种治疗方法，都应当强调良好的饮食习惯和个人卫生的重要性。建议患者保持规律的生活作息，避免过度劳累及精神压力过大；合理安排膳食结构，减少刺激性食物的摄入等。

总之，在消化系统疾病的治疗过程中，将传统中医与现代西医有机结合，不仅可以提高临床疗效，还能更好地满足患者的个性化需求。但需要注意的是，所有药物使用均应在专业医师指导下进行。