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（1）咖啡因易与人体内游离的钙结合，结合物随尿液排出体外，因此长期饮用咖啡引起缺钙，诱发骨质疏松症。
（2）过量饮用咖啡，可导致人体过度兴奋，出现紧张、失眠、心悸、目眩、四肢颤抖；长期饮用咖啡者一旦停饮，容易出现大脑高度抑制，表现为血压下降、头痛、狂躁、抑郁等。
（3）咖啡可以刺激胃液和胃酸分泌，胃酸过多或有胃溃疡的人不宜饮用。
（4）咖啡可兴奋中枢神经，拮抗中枢镇静药、催眠药的作用，患有失眠、烦躁、高血压者不宜长期饮用。过量饮用咖啡会使抗感染药的血浆药物浓度降低。咖啡因为黄嘌呤类化合物，与单胺氧化酶抑制剂合用，可引起过度兴奋、血压升高等表现。
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