1.肝硬化胆管梗阻后胆道内压力增加，胆管细胞明显增生，肝胶原蛋白含量显著增加。梗阻后胆汁酸盐的淤积促使肝细胞凋亡，肝萎缩变小。持续黄疸又使肝血流量减少，进一步发展成肝硬化和门静脉高压。
2.内毒素血症肝受损后致单核巨噬细胞系统（尤其是Kupffer细胞）功能受损，清除血中内毒素的能力降低。另外，黄疸时肠管内因缺乏胆盐而致菌群失调，且肠粘膜屏障功能遭到破坏，更易发生内毒素血症。
3.肾功能损害高结合胆红素血症可增加肾对缺氧损害的敏感性，胆汁酸的升高可损伤肾动脉内皮细胞诱发血管内凝血，引起肾缺血。此外，内毒素血症也促发血管内凝血，以致肾功能受损。
4.破坏胃粘膜屏障高胆红素血症或反流到胃内的胆汁酸均可损害胃粘膜屏障，导致应激性溃疡和胃粘膜出血。
5.对心脏的损害在高胆红素血症和胆汁酸升高的直接作用下，可引起心肌收缩无力、心排血量减少，血压下降和心率减慢。
6.免疫功能降低除Kupffer细胞功能受抑制外，T淋巴细胞的活性也降低。待黄疸解除4周后才恢复到正常水平。
7.皮肤刺激胆盐对皮肤感觉末梢的刺激可引起严重的皮肤瘙痒。
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