原发性TIN按其肾脏病理变化的特点分为：急性TIN和慢性TIN；而继发性TIN除肾间质的病理改变外，因其原发疾病的不同，具有不同的肾小球和。肾血管病变。原发性TIN肾脏病理变化的特点如下：

　　（一） 急性TIN

　　肾脏体积增大；近端肾小管和髓袢降支粗段较远端肾小管损伤严重，常可见刷状缘脱落，上皮细胞扁平、脱落；肾小管的形状基本完整，但可以出现由于单核细胞浸润造成的小管基底膜局部丧失；肾小球和肾小血管正常。特征性改变是弥漫或片状分布的肾间质中大量的单个核细胞（主要为激活的淋巴细胞和巨噬细胞）浸润，也可出现多核白细胞、成纤维细胞、组织细胞，甚至肉芽肿样反应。药物性相关性TIN和肾小管间质性肾炎一葡萄膜炎综合征主要以嗜酸性粒细胞浸润为主。

　　（二） 慢性TIN

　　肾脏外观缩小，表面成疤痕状；肾间质纤维化；片状分布的肾小管萎缩和扩张是慢性TIN的主要特征，损伤萎缩的肾小管周围可以出现代偿性肥厚扩张的肾小管。早期肾小球和肾小血管正常，进展的慢性TIN肾小血管可以出现动脉硬化样改变；晚期出现严重的肾小球周围纤维化和肾小球硬化；可伴有不同程度的肾间质单核细胞浸润。但马兜铃酸肾病（aristolochic acid nephropathy）时肾间质无明显的炎症细胞浸润，寡细胞性肾间质纤维化是马兜铃酸肾病的特征性改变。

　　一般情况下，原发性TIN免疫荧光检查阴性，在少数病例可以出现免疫荧光检查阳性。但除了由抗基底膜抗体引起的TIN，肾小管基底膜可见到特征性线形荧光具有诊断意义外，其他无诊断价值。