在使用生物素-亲和素系统进行临床免疫学检测时，需要注意以下几个方面的问题：
1. 生物素与亲和素之间的结合力非常强，这种高亲和性可以提高检测的灵敏度，但也可能导致非特异性结合增加。因此，在设计实验时需要优化反应条件，如选择合适的缓冲液、调节pH值及离子强度等，以减少背景干扰。
2. 生物素化过程中可能会出现过度或不足的情况，这会影响生物素与目标分子的有效连接。因此在进行生物素标记之前要确保所使用的试剂质量可靠，并且严格按照说明书操作。
3. 亲和素是一种糖蛋白，容易受到温度变化的影响而失活。此外，某些条件下（如高浓度盐溶液）也可能导致其活性降低。所以在保存和使用过程中要注意控制环境条件，避免影响检测效果。
4. 生物素-亲和素系统在放大信号的同时也可能会放大非特异性结合的背景噪音。因此，在设计实验时应考虑加入封闭步骤来减少非特异性的吸附作用，并通过设置阴性对照组来判断结果的真实性。
5. 由于生物体内存在内源性生物素，这可能对检测产生干扰。为了避免这种情况的发生，可以采用链霉亲和素替代常规的亲和素，因为链霉亲和素与生物素之间的结合具有更高的选择性和特异性。
6. 进行多步骤标记时，需要保证每一步反应都充分完成并彻底清洗去除未参与反应的成分，以确保最终结果准确可靠。

总之，在使用生物素-亲和素系统进行免疫检测时，应根据具体的实验目的和样本特性精心设计实验方案，并严格控制操作流程中的各个细节。