克罗恩病是一种病因尚不十分清楚的胃肠道慢性炎性肉芽肿性疾病，治疗原则主要包括控制病情活动、维持缓解及防治并发症。

在治疗目标方面，诱导缓解和维持缓解，促进黏膜愈合，防止复发，防治并发症，改善患者生活质量。

一般治疗上，强调饮食调理和营养补充，一般给予高营养低渣饮食，适当给予叶酸、维生素B12等多种维生素及微量元素。要素饮食在补充营养同时，还能减少食物消化产物对病变部位的刺激，适用于有肠道狭窄并发不全肠梗阻的患者。病情严重时需要禁食，给予完全胃肠外营养。对于腹痛、腹泻的对症治疗，要权衡利弊，使用抗胆碱能药物或止泻药如地芬诺酯或洛哌丁胺等需谨慎，因为有诱发中毒性巨结肠的可能。

药物治疗是关键环节。氨基水杨酸制剂对控制轻、中型患者的活动性有一定疗效，但仅适用于病变局限在结肠者。糖皮质激素是目前控制病情活动最有效的药物，适用于中、重型患者或对氨基水杨酸制剂无效的轻型患者。免疫抑制剂如硫唑嘌呤或巯嘌呤可用于对激素治疗效果不佳或对激素依赖的慢性活动性病例，加用这类药物后可逐渐减少激素用量乃至停用。生物制剂如英夫利昔单抗，对于传统治疗无效的中重度克罗恩病有效，可快速控制病情，促进黏膜愈合。

手术治疗主要用于有并发症的患者，如完全性肠梗阻、瘘管与脓肿形成、急性穿孔或不能控制的大量出血等，但术后复发率较高。所以手术治疗必须严格掌握手术适应证。

此外，还需要对患者进行长期的随访，定期评估病情，根据病情变化及时调整治疗方案，以达到最佳的治疗效果。