军团菌肺炎是由嗜肺军团菌引起的以肺炎表现为主，可能合并肺外其他系统损害的感染性疾病，通常选用以下几类药物进行治疗。

首先是大环内酯类抗生素，这是治疗军团菌肺炎的经典用药。比如红霉素，它能透过细菌细胞膜，与细菌核糖体的50S亚基可逆性结合，阻断转移核糖核酸（tRNA）结合至“P”位上，同时也阻断多肽链自受位（“A”位）至“P”位的位移，从而抑制细菌蛋白质合成。不过红霉素可能会有一些胃肠道反应等副作用。阿奇霉素也是常用药物，它在组织中浓度高，半衰期长，每日仅需给药一次，患者的依从性较好，抗菌谱更广，抗菌活性也比红霉素有所增强，对军团菌有较强的抑制作用。

其次是喹诺酮类药物，像左氧氟沙星、莫西沙星等。这类药物主要是通过抑制细菌DNA旋转酶（细菌拓扑异构酶Ⅱ）的活性，阻碍细菌DNA复制而达到杀菌、抗菌的目的。它们具有抗菌谱广、抗菌活性强的特点，在肺组织中的浓度较高，能有效杀灭军团菌。而且与其他药物的相互作用相对较少，副作用相对较轻。

此外，四环素类药物如多西环素也可用于军团菌肺炎的治疗。它能特异性地与细菌核糖体30S亚基的A位置结合，阻止氨基酰－tRNA在该位上的联结，从而抑制肽链的增长和影响细菌蛋白质的合成。

在治疗过程中，医生会根据患者的具体情况，如病情严重程度、年龄、基础疾病、药物过敏史等来选择合适的药物。对于病情较重的患者，可能需要联合使用不同种类的抗菌药物，以增强治疗效果。同时，治疗过程中还需要密切观察患者的症状、体征以及相关检查指标的变化，及时调整治疗方案。一般来说，军团菌肺炎的治疗疗程相对较长，通常需要2 - 3周，以确保彻底清除病原体，防止病情复发。