肠结核确诊检查需要综合多种方法，以下为您详细介绍：

首先是实验室检查。血常规检查中，患者可能有不同程度的贫血，无并发症时白细胞计数一般正常。血沉多明显增快，可作为评估结核病活动程度的指标之一。结核菌素试验强阳性有助于诊断，但阴性不能排除肠结核。粪便检查方面，显微镜下可见少量脓细胞和红细胞，粪便浓缩找结核杆菌，阳性者有助于诊断，但仅在痰液检查阴性才有意义。

影像学检查也十分关键。X线胃肠钡餐造影或钡剂灌肠检查对肠结核的诊断具有重要价值。在溃疡型肠结核中，钡剂在病变肠段呈现激惹征象，排空很快，充盈不佳，而在病变的上、下肠段则钡剂充盈良好，称为X线钡影跳跃征象。增生型肠结核时可见肠壁增厚，肠腔狭窄，肠段缩短变形，回肠和盲肠的正常角度消失。腹部CT检查可以更清晰地显示肠壁增厚、肠腔狭窄、淋巴结肿大等情况，对于发现腹部其他部位的结核病灶也有帮助。

结肠镜检查是确诊肠结核的重要方法。它可以直接观察全结肠和回肠末段的病变情况，并可取组织进行病理检查。肠结核病变主要位于回盲部，内镜下可见病变肠黏膜充血、水肿，溃疡形成（常呈环形、边缘呈鼠咬状），大小及形态各异的炎症息肉，肠腔变窄等。活检如能找到干酪样坏死性肉芽肿或结核分枝杆菌，则具有确诊意义。

此外，对于高度怀疑肠结核但无法确诊的患者，可进行诊断性抗结核治疗。若治疗数周内症状明显改善，2 - 3个月后肠镜检查病变明显好转或愈合，则支持肠结核的诊断。

综上所述，肠结核的确诊需要结合患者的临床表现、实验室检查、影像学检查以及结肠镜检查和病理结果等多方面因素进行综合判断，其中结肠镜检查及病理发现干酪样坏死性肉芽肿或结核分枝杆菌是确诊的金标准。