外科使用抗菌药的指征主要包括以下几个方面。

首先是清洁 - 污染手术。这类手术的手术部位存在大量人体寄殖菌群，手术时可能污染手术野引致感染，所以一般需要预防性使用抗菌药物。例如胃肠道手术，胃肠道内本身存在大量细菌，手术过程中可能导致细菌污染手术切口，为预防术后感染，就需要使用抗菌药。还有呼吸道手术，呼吸道也有一定数量的细菌，手术操作可能破坏呼吸道的正常防御机制，增加感染风险，故需预防性用药。

其次是污染手术。这类手术由于胃肠道、尿路、胆道体液大量溢出或开放性创伤未经扩创等已造成手术野严重污染，必须使用抗菌药物。比如开放性骨折手术，伤口直接暴露在外界环境中，容易被细菌污染，不使用抗菌药，术后发生感染的几率极高。又如胃肠道穿孔修复手术，胃肠道内的消化液和细菌会溢出到腹腔，引起严重的腹腔感染，使用抗菌药是预防和控制感染的关键措施。

再者，对于严重创伤、大面积烧伤、休克、昏迷、恶性肿瘤、应用免疫抑制剂等患者，机体抵抗力下降，容易并发感染，可根据情况预防性或治疗性使用抗菌药。例如严重烧伤患者，皮肤屏障功能受损，大量体液丢失，细菌容易入侵，为防止感染扩散，需要合理使用抗菌药。

另外，手术范围大、手术时间长、污染机会增加的手术也需要使用抗菌药。长时间的手术操作会增加手术野暴露于外界环境的时间，细菌污染的可能性增大，预防性使用抗菌药可以降低术后感染的发生率。

最后，涉及重要脏器的手术，一旦发生感染将造成严重后果，通常也需要使用抗菌药。比如心脏手术、颅脑手术等，这些部位一旦感染，可能会对患者的生命健康造成极大威胁，因此术前、术中、术后合理使用抗菌药是保障手术安全的重要手段。