不同产地的冬虫夏草差异是比较大的。西藏那曲虫草、西藏林芝虫草、青海虫草以及四川虫草这些不同产地的虫草是有明显区别的，采挖时间、虫草体色和药用价值都不同。一般从时间来说，5、6月间采集的虫草质量最好，海拔越高，天气转暖就越，冬虫夏草的采挖期同样就越晚。而且海拔越高，虫草质量也就越上乘。从地形来讲，阳坡的虫草相对于阴坡要好。从产区来讲，西藏那曲虫草为最上乘，尤其是色度和大小;较差的是四川虫草，个头较小、颜色较黑、子座较长。西藏由于气候条件差异，西藏虫草采挖期比其他省区再推迟半月或一月左右。那曲地区五月份虫草就已经开始生长。

虫草因其产地海拔高度不同、品质差异较大。西藏那曲是海拔最高的虫草产区，产区海拔高度约4500－6000米;其次是青海，产区海拔高度约 3000－4000米;再次是四川和其它地区，虫草的品质就较差了。色泽也各异，以虫草眼睛的颜色最明显。西藏那曲所产虫草眼睛颜色为棕色，青海玉树和果洛所产虫草眼睛颜色为黄色，川草和其它地区所产的草多为红色。