全草入药，性苦、寒，有小毒。清热解毒、活血止血，外用治湿疹、疮疖、无名肿毒、毒蛇咬伤、跌打损伤，内服治劳伤腰痛、肺结核、咳血等症。

血根碱和白屈菜红碱对对动物有抗肿瘤作用，但对人毒性大。在苏联从白屈菜及博落回全草提取上述二生物碱的硫酸盐混合物，用作抗菌剂和抗胆碱酯酶药，抗菌谱很广，对多种细菌、真菌和滴虫均有很强的杀灭作用。血水草在民间可作为外用抗菌药。动物实验结果表明血水草能增加白血球和网状内皮系统的吞噬能力。