与庆大霉素相似，耳毒作用与卡那霉素更相似，肾功能减退患者应减量或延长给药间隔。

本品的耳毒性和肾毒性与卡那霉素相近，故肾功能减退者、脱水者、老年患者及使用强效利尿剂的患者应慎用或减量。其他副作用尚有恶心、呕吐、头痛、药物热、关节痛、贫血及肝功能异常等。个别病人出现过敏性休克。

可有听力及肾损害.可引起胃肠道反应：恶心,呕吐,食欲不振,腹胀,腹泻.个别病例有药热,皮疹,肌肉震颤,麻木,关节痛,嗜酸性粒细胞增多.可引起肝损害,贫血,血压下降.长期使用,可引起二重感染.

用药后可发生耳鸣、耳部饱胀感，高频听力减退，严重者可进展至耳聋。前庭功能损害亦偶有报道。一般于停药后症状可逐渐减轻或恢复，但个别在停药后仍继续发展至耳聋。肾脏可出现轻度损害或尿素氮、血肌酐值升高，严重者可出现肾功能衰竭。肾脏损害大多为可逆性，发生率<10%，停药后可恢复。过去曾用过庆大霉素等氨基糖甙类为重要的诱发因素。

神经肌肉接头阻滞反应较少见，其他反应有恶心、呕吐，偶见头痛、药热、皮疹、震颤、麻木、关节痛、嗜酸性粒细胞增多、肝功能异常、贫血、低血压及视力模糊等。较长时期应用后亦可引起念珠菌二重感染。