腹泻的原发疾病或病因诊断主要须从病史、症状、体征、常规化验特别是粪便检验中获得依据。许多病例通过仔细分析病史和上述检查的初步结果，往往可以得出正确诊断。

若诊断仍不清楚，可进一步作X线钡灌肠和钡餐检查，和（或）直、结肠镜检查。如仍无明确结论，则须根据不同情况选用超声、CT、内镜逆行胆胰管造影（ERCP）等影象诊断方法以检查胆、胰疾病，或进行小肠吸收功能试验、呼气试验、小肠粘膜活检以检查小肠吸收不良。

高度怀疑肠结核、肠阿米巴病等有特效治疗的疾病，经过努力都不能确诊时，可在一定限期内进行治疗试验。

反复多次查大便常规，病原学检查，各种细菌培养、查阿米巴原虫及病毒等。此外，专家认为还可以通过下列检查来诊断慢性腹泻：（字数限制，详情参看）

1．指诊。

2．乙状结肠镜检查。

3．纤维肠镜检查。

4．钡灌肠。

5．内镜逆行胰胆管造影(ERCP)有重要价值。

6．X线钡餐、钡灌肠检查和腹部平片。

7．B超、CT或MRI(核磁共振）

怎么通过粪便形状来诊断腹泻原因

（1）若粪便为灰白色，可能是结石、肿瘤、蛔虫等引起胆道梗阻，导致胆黄素无法随大便排出；

（2）若为黑色，在没有进食动物血制品和黑色的食物、药物的前提下，则可能是上消化道出血；

（3）粪便为红色则常提示下消化道出血；

（4）有柏油样腥臭味的粪便常提示痢疾；

（5）淡黄色则提示脂肪消化不良；

（6）多泡沫、酸臭味一般多为糖消化不良；

（7）恶臭则为蛋白质消化不良以及肠道有害菌多。

（8）大便中还能直接看到寄生虫或者虫多为寄生虫导致。