由于你没有明确指出“二者”具体是什么，下面我以中西医结合执业医师考试中常见的中药和西药作用机制的区别为例进行解答。

中药和西药在作用机制上存在显著差异。

从作用途径来看，西药通常是通过明确的化学结构和作用靶点来发挥作用。西药研发是基于现代科学实验，对药物的成分、作用机制进行深入研究，其作用靶点往往非常精确，比如降压药硝苯地平，它主要作用于血管平滑肌细胞膜上的钙离子通道，通过阻滞钙离子内流，使血管平滑肌松弛，从而降低血压，作用途径清晰、直接。

而中药的作用机制相对复杂。中药大多是多种化学成分组成的混合物，其作用往往是多靶点、多途径的整体调节。以中药方剂六味地黄丸为例，它由熟地黄、山茱萸、山药等多味中药组成。熟地黄含有梓醇等成分，山茱萸含熊果酸等成分，这些成分相互协同，可能作用于人体的多个系统，如免疫系统、内分泌系统等，调节机体的阴阳平衡，改善肾阴虚的症状，并不是针对某一个特定的靶点发挥作用。

从起效速度来说，西药一般起效较快。比如退烧药布洛芬，口服后能在较短时间内抑制下丘脑体温调节中枢前列腺素（PG）的合成及释放，从而发挥解热、镇痛作用，通常半小时到一小时就能见到体温下降。而中药起效相对较慢，它是通过逐渐调整人体的内环境、增强机体自身的抵抗力来达到治疗目的，像一些慢性疾病如慢性肾炎，服用中药调理可能需要数周甚至数月才能看到明显的效果。

从安全性和不良反应来看，西药的不良反应相对较为明确，在药品说明书中会详细列出可能出现的各种不良反应，这是因为其作用机制研究得较为透彻。而中药的不良反应有时不太容易明确界定，一方面是因为其成分复杂，另一方面中药的使用讲究辨证论治，如果用药不当可能会出现不良反应，但这些不良反应可能与中药的炮制、配伍、用量等多种因素有关。

综上所述，中药和西药在作用机制上各有特点，在临床治疗中，中西医结合往往能取长补短，发挥更好的治疗效果。