新生儿黄疸是新生儿期常见的症状之一，西医认为其病因主要分为生理性和病理性两大类。

生理性黄疸的病因主要与新生儿胆红素代谢特点有关。新生儿出生后，血氧分压升高，过多的红细胞破坏，使胆红素生成相对较多。而且新生儿肝细胞内 Y、Z 蛋白含量低，对胆红素摄取能力不足。同时，新生儿肝脏尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶（UGT）的量及活性不足，形成结合胆红素的能力差。另外，新生儿的肠肝循环特点使得胆红素重吸收增加，这些因素共同导致生理性黄疸的出现，一般在出生后 2 - 3 天出现，4 - 6 天达到高峰，足月儿在 2 周内消退，早产儿可延迟至 3 - 4 周。

病理性黄疸的病因则较为复杂。胆红素生成过多方面，包括红细胞增多症，如母 - 胎或胎 - 胎输血等使新生儿红细胞增多，破坏后产生过多胆红素；头颅血肿、皮下血肿等引起血管外溶血，增加胆红素生成；同族免疫性溶血，如 ABO 血型不合、Rh 血型不合等，胎儿红细胞被母体抗体破坏；感染，如细菌、病毒感染可抑制肝脏 UGT 的活性，同时增加红细胞破坏，导致胆红素生成增多；肠肝循环增加，如先天性肠道闭锁、先天性幽门肥厚等使胎粪排出延迟，胆红素重吸收增加。

肝脏胆红素代谢障碍也会引发病理性黄疸。新生儿肝炎多由病毒引起，如巨细胞病毒、乙肝病毒等，可导致肝细胞受损，影响胆红素代谢；先天性 UGT 缺乏，可使胆红素不能有效结合为结合胆红素而在体内蓄积；先天性非溶血性高未结合胆红素血症，是由于遗传因素导致肝脏对胆红素的摄取、结合或排泄障碍。

胆汁排泄障碍同样是重要病因。先天性胆道闭锁，由于胆道发育异常，胆汁无法正常排泄到肠道，导致结合胆红素在体内积聚；先天性胆总管囊肿，可造成胆汁引流不畅；胆管扩张症、肝和胆道的肿瘤等也可压迫胆管，影响胆汁排泄，进而引发黄疸。