阴阳学说的基本内容涵盖了阴阳对立制约、阴阳互根互用、阴阳交感与互藏、阴阳消长、阴阳转化和阴阳自和与平衡等方面。

阴阳对立制约，指属性相反的阴阳双方在一个统一体中的相互斗争、相互制约和相互排斥。自然界中，如四季气候的变化，夏季阳热盛，但夏至以后阴气却渐次以生，用以制约炎热之阳；冬季阴寒盛，冬至之后阳气又随之渐生，以制约严寒之阴。人体生理活动中，兴奋与抑制两种状态相互制约，维持着人体的正常生理功能。

阴阳互根互用，互根是指阴阳双方相互依存，任何一方都不能脱离另一方而单独存在；互用是指阴阳双方相互资生、相互促进和相互为用。比如人体的气和血，气属阳，血属阴，气能生血、行血、摄血，血能载气、养气，二者相互依存、相互为用。

阴阳交感与互藏，交感是指阴阳二气在运动中相互感应而交合，是宇宙万物赖以生成和变化的根源。互藏是指相互对立的阴阳双方中的任何一方都包含着另一方，即阴中有阳，阳中有阴。如人体五脏属阴，但五脏之中又各有阴阳，心有心阴和心阳。

阴阳消长，是指阴阳双方不是静止不变的，而是处于不断的增长和消减的变化之中。这种消长是在一定限度、一定范围、一定时间内进行的，维持着事物的动态平衡。如白天阳长阴消，夜晚阴长阳消。

阴阳转化，指事物的阴阳属性在一定条件下可以向其相反的方向转化，即属阳的事物可以转化为属阴的事物，属阴的事物可以转化为属阳的事物。如人体在某些疾病发展过程中，原本的寒证可能转化为热证，热证也可能转化为寒证。

阴阳自和与平衡，自和是指阴阳双方自动维持和调节恢复其协调平衡状态的能力和趋势。平衡是指阴阳双方在相互斗争、相互作用中处于大体均势的状态，即阴阳协调和相对稳定状态。人体的生理活动就是阴阳自和与平衡的结果，一旦这种平衡被打破，疾病就会随之发生。