十二经别与十二正经是中医学中非常重要的概念，它们在人体生理和病理方面都发挥着重要作用。但是两者之间存在明显区别。

首先，从定义上来看，十二正经是指手三阴（肺、心包、心），手三阳（大肠、小肠、三焦），足三阴（脾、肝、肾）以及足三阳（胃、胆、膀胱）等十二条经脉。它们是人体经络系统的主要组成部分，分布于四肢和躯干，贯穿五脏六腑，负责输送气血，调节阴阳平衡，维持机体正常的生命活动。

而十二经别则是从十二正经分出的分支，每条正经都有一条对应的经别。它们是从四肢肘膝以上部位开始，向内延伸至胸腹或头面等处的深层组织器官，并且有返回到体表的趋势。经别的主要功能在于加强了脏腑与体表之间的联系，使体内气血能够更好地流通和调节。

其次，在生理功能方面，十二正经主要是负责输送全身各部位所需的营养物质，维持人体正常的新陈代谢；而十二经别则是在此基础上进一步促进了气血的循环，增强了机体抵御外邪的能力。当外界环境变化或内部机能失调时，通过调整经别的状态可以达到预防和治疗疾病的目的。

另外，在临床应用上，两者也有明显区别。在针灸、推拿等治疗方法中，通常会根据病情选择合适的穴位进行刺激，而这些穴位往往位于十二正经之上；但当遇到一些复杂或难以治愈的病症时，则需要结合使用十二经别的理论来寻找更为有效的治疗方案。

总之，虽然十二经别与十二正经都是构成人体经络系统的重要部分，但是它们在解剖位置、生理功能以及临床应用等方面都存在着显著差异。理解并掌握这两者之间的关系对于提高中医诊疗水平具有重要意义。