针灸治疗小儿多动症时，主要会选择与脑功能调节密切相关的经络和穴位。在中医理论中，认为小儿多动症的发生与肝肾不足、心脾两虚等因素有关，因此，在选择经络时会注重调治这些脏腑的功能。
1. 肝经：肝主疏泄，与情绪活动密切相关。小儿多动症患者往往伴有情绪不稳定的表现，如易怒、急躁等，故治疗时常选取足厥阴肝经的穴位以平肝息风、安神定志。
2. 心经：心藏神，主管精神意识和思维活动。对于注意力不集中、记忆力差等症状，可以通过刺激手少阴心经上的穴位来达到养心安神的效果。
3. 脾经：脾为后天之本，负责运化水谷精微，与人体气血生成及脑髓充盈有关。选取足太阴脾经的穴位可以健脾益气、固肾填精，改善多动症儿童体质虚弱的情况。
4. 督脉和任脉：督脉为阳脉之海，总领全身阳气；任脉则为阴脉之海，负责调节全身阴液。通过针刺或艾灸督脉上的百会、神庭等穴位以及任脉上的关元、中脘等穴，能够调和阴阳平衡，促进大脑功能恢复。
5. 肾经：肾藏精，主生长发育，与儿童的智力发展密切相关。选取足少阴肾经上的太溪、照海等穴位有助于补益肾精，增强脑髓的功能。

在实际操作中，医生会根据患儿的具体病情及体质特点灵活配伍上述经络中的相关穴位进行治疗，并结合其他辅助疗法如耳针、推拿按摩等方法综合施治。同时，家长也需要配合医生做好日常护理工作，包括合理安排作息时间、保证充足睡眠、均衡饮食等方面，共同促进患儿康复。