疟疾在临床诊断中需要与其他一些具有相似症状的疾病进行鉴别，以确保准确的治疗。主要需要鉴别的疾病包括：
1. 流行性感冒：流感患者也会出现发热、寒战等症状，但通常伴有明显的呼吸道症状如咳嗽、咽痛等。而疟疾患者的发热多呈周期性，并且伴随有脾肿大等体征。
2. 败血症：败血症是由细菌感染引起的全身炎症反应综合征，可导致高热、心率加快、呼吸急促等症状，严重时甚至危及生命。虽然两者都可能出现持续高烧的情况，但是败血症患者血液培养阳性可以作为重要的鉴别点之一。
3. 钩端螺旋体病：此病由钩端螺旋体引起，主要通过接触受污染的水或土壤传播。临床表现为发热、肌肉疼痛（尤其是小腿）、眼结膜充血等。与疟疾不同的是，钩端螺旋体病患者尿液检查可见蛋白尿、血尿。
4. 登革热：登革病毒引起的急性传染病，其特征为突发高烧、剧烈头痛、骨关节痛和皮疹。尽管部分症状与疟疾相似，但登革热的出血倾向更为明显，并且可通过血液或唾液样本检测到特异性抗体来辅助诊断。
5. 伤寒：由沙门氏菌属中的伤寒杆菌引起的一种肠道传染病，主要表现为持续高烧、腹痛腹泻等。与疟疾相比，伤寒患者的血象改变较为特殊，白细胞计数降低且嗜酸性粒细胞减少。
6. 斑疹伤寒：立克次体感染所致的急性发热性疾病，典型症状为突然起病、剧烈头痛和特征性的皮疹。该病可通过血液涂片寻找包涵体或PCR技术检测特异性DNA来与疟疾相区别。

在实际临床工作中，医生会根据患者的流行病学史（如是否到过疫区）、具体临床表现以及实验室检查结果等多方面信息综合判断，并采取相应的治疗措施。