疟疾在临床诊断中需要与其他一些疾病进行鉴别，以确保准确治疗。主要需要鉴别的疾病包括：
1. 流行性感冒（流感）：流感也是一种由病毒引起的急性呼吸道传染病，患者可出现发热、头痛、肌肉痛等症状，但与疟疾不同的是，流感没有周期性的寒战和高热症状，并且白细胞计数通常正常或偏低。
2. 败血症：败血症是由细菌感染引起的一种全身性炎症反应综合征。虽然败血症患者也会出现发热、寒战等表现，但是败血症的病情进展更为迅速，常伴有血压下降、多器官功能障碍等症状，实验室检查可见白细胞显著升高或降低。
3. 钩端螺旋体病：这是一种由钩端螺旋体引起的动物源性传染病。临床表现为急性起病，发热、头痛、眼结膜充血、腓肠肌疼痛等，部分病例可出现黄疸和出血倾向。通过血清学检测可以与疟疾相区别。
4. 登革热：登革热是由登革病毒引起的一种蚊媒传播疾病，主要症状包括突发高热、剧烈头痛、眼窝痛、关节和肌肉疼痛以及皮疹等。登革热的发热模式通常为双峰型（即发热几天后退烧1-2天再复燃），这与疟疾的周期性发作不同。
5. 斑疹伤寒：斑疹伤寒是由立克次体引起的一种急性传染病，患者可出现高热、头痛、皮疹等症状。通过血清学检查和病原体分离可以明确诊断。
6. 伤寒与副伤寒：这两种疾病均由沙门氏菌属细菌感染所致，临床特点为持续发热、相对缓脉、玫瑰疹等，可通过血液培养和肥达反应来鉴别。
7. 非典型肺炎：非典肺炎患者可有发热、干咳、呼吸困难等症状，但无疟疾特有的周期性寒热发作。胸部影像学检查有助于诊断。

总之，在面对疑似疟疾病例时，医生应综合考虑患者的流行病学史（如是否有疫区旅行史）、临床表现及实验室检查结果，必要时还需与其他相关疾病进行鉴别诊断。