儿童蛋白质-能量营养不良（PEM）是一种由于长期摄入不足或吸收障碍导致的能量和蛋白质缺乏症。在临床上，诊断儿童蛋白质-能量营养不良主要依据病史、体格检查以及实验室检查等多方面的信息。
1. 病史收集：了解患儿的饮食习惯、喂养方式及喂养困难情况；询问家族中有无类似疾病或其他遗传性疾病；注意观察生长发育迟缓的情况及其持续时间；关注近期有无感染或慢性消耗性疾病等因素影响营养状况。
2. 体格检查：
   - 体重和身高测量：根据年龄别体重（WFA）、身长/高别体重（WLZ）及年龄别身长/高（LAZ）等指标评估患儿的生长发育状态。若低于同龄儿童平均值两个标准差以上，则可能提示存在营养不良。
   - 身体检查：注意观察皮肤黏膜、毛发和指甲的变化，如干燥无光泽、易脱落；肌肉萎缩、腹部膨胀；面部浮肿等表现均可能是蛋白质-能量营养不良的迹象。此外还需检查有无其他系统受累的表现。
3. 实验室检查：
   - 血常规：可发现贫血或低蛋白血症。
   - 尿常规：尿比重降低，可能伴有酮体阳性。
   - 肝功能检测：部分患儿可能出现转氨酶升高。
   - 全身状况评估时还可以进行电解质、血糖等项目检查。
4. 辅助诊断工具：
   - 生长曲线图：利用生长曲线图跟踪儿童的体重和身高变化趋势，对早期发现营养不良有重要价值。
   - 人体测量学指标：如上臂围（MUAC）、皮褶厚度等也可作为辅助判断标准之一。

综合以上各方面信息，并结合临床表现进行综合分析，可以较为准确地诊断出儿童是否患有蛋白质-能量营养不良。同时，在确诊后还需要进一步查找原因并给予针对性治疗。