囊性纤维化患者经常有铜绿假单胞菌长期寄居，但是还没有带有可传播菌株个体交叉感染的报道。但是有报道交叉感染可以发生。
在一项研究中，英国利物浦研究人员描述了4位成人囊性纤维化患者，这些患者长期有铜绿假单胞菌寄居，并且交叉感染有这种细菌的可传播菌株。所有患者都是在住院期间接触寄居个体后感染的。研究人员称，他们认为，在那些含有流行性菌株的科室中，所有囊性纤维化患者都有双重感染的危险，并且需要经常进行铜绿假单胞菌菌株分型。
在另一项研究中，英国曼彻斯特研究人员发现一种新型的铜绿假单胞菌多抗性菌株，该菌株引起了154位长期寄居囊性纤维化患者中22位的交叉感染。研究人员称，通常认为假单胞菌不会交叉感染囊性纤维化患者，除这种新发现的菌株外，他们的某些患者中也存在利物浦菌株。因此他们有了两种菌株能引起交叉感染的证据。由于诸多原因，新菌株很不寻常，它是非色素沉着的，并且表现出多种抗生素抗性，并且这种菌株似乎不能移动或移动能力很差。对于铜绿假单胞菌而言，低移动性意味着侵袭力水平低，但是目前还不知道这一新菌株的毒性。根据目前的发现，研究人员认为需要在其它囊性纤维化中心进行更严格的监视来寻找交叉感染的证据。
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