在食品加工过程中，有效杀灭致病菌的方法主要包括物理方法和化学方法。物理方法主要是利用温度、压力等条件来杀死细菌，而化学方法则是通过添加一些能够抑制或杀死细菌的物质。
1. 热处理：这是最常用的杀菌方式之一，包括巴氏消毒法（低温长时间）和高温瞬时灭菌法。前者适用于牛奶等液态食品，后者则用于罐头等固体食品。热处理可以有效杀灭大多数致病微生物，但需注意控制好温度与时间以保持食品的营养价值不受影响。
2. 冷冻/冷藏：虽然冷冻不能完全杀死细菌，但它能显著减缓其生长速度，延长食品安全保存期。对于一些不耐高温的食物如海鲜、果蔬等非常适用。
3. 高压处理（HPP）：通过施加极高的压力来破坏微生物细胞结构从而达到杀菌效果，同时对食品营养成分影响较小，是一种较为先进的非热力杀菌技术。
4. 辐照技术：利用γ射线或电子束照射食品，能有效杀死内部及表面的细菌。此方法特别适合于调味品、干果等不易加热处理的产品。
5. 添加防腐剂：如山梨酸钾、苯甲酸钠等化学物质具有良好的抗菌性能，在一定浓度下可以抑制细菌生长繁殖。但使用时需严格遵守国家相关标准，确保对人体无害。
6. 酸化或碱化处理：通过调整食品pH值至不利于致病菌生存的范围来实现杀菌目的，如制作泡菜、酸黄瓜等发酵食品时就会利用这一原理。
7. 紫外线消毒：适用于空气和水的净化以及部分包装材料表面的杀菌。对于某些液体产品（如果汁）也可以采用紫外线进行处理。

综上所述，在实际应用中往往需要根据具体产品的特性，选择合适的杀菌方法或组合多种技术手段以达到最佳效果，并且在整个加工过程中实施严格的卫生管理措施，确保食品安全。