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Ig分子是由三个不连锁的Igκ、Igλ和IgH基因所编码。Igκ、Igλ和IgH基因定位于不同的染色体上（下表）。编码一条Ig多肽链的基因是由在胚系中多个分隔的DNA片段（基因片段）经重排而形成的。1965年Dreyer和Bennet首先提出假说，认为Ig的V区和C区是由分隔存在的基因所编码，在淋巴细胞发育过程中这两个基因发生易位而重排在一起。1976年日本学者利根川进应用DNA重组技术证实了这一假说。利根川进由此获得1987年医学和生理学诺贝尔奖。
表 免疫球蛋白基因定位
| 编码多肽链 | 基因符号（人） | 基因染色体定位 | ||
| 人 | 小鼠 | |||
| κ轻链 | Igκ | 2 | 6 | |
| λ轻链 | Igλ | 22 | 16 | |
| 重链 | IgH | 14 | 12 | |
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