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一、疾病预防和健康促进：预防包括无病时预防使其不发生，发生后使其得到控制或减少直到消除。这在传染病和寄生虫病预防较明显。预防分为策略和措施两类。前者是方针，属于战略性和全局性的。后者是具体手段，是战术性和从属性的。随着健康流行病学出现，使现代流行病学各方面的理解和扩展至健康状态。

二、疾病的监测：是长期地、连续地在一个地区范围内收集并分析疾病及其影响因素的动态，以判断疾病及其影响因素的发展趋势，并评价预防对策的效果或决定是否修改已制定的预防对策。

三、疾病病因和危险因素的研究：透彻了解疾病发生、多发或流行的原因才能更好地防制乃至消灭某一疾病。有时，真正的病因尚未完全阐明，诸多危险因素已被发掘出来。

四、疾病的自然史：该应用是通过流行病学方法研究人类疾病和健康的发展规律，以进一步应用于疾病预防和健康促进。

五、疾病效果评价：涉及到防制疾病效果的最终判断。如观察儿童接种某疫苗后，是否阻止了相应疾病的发生，可用实验流行病学的方法比较受试儿童和对照儿童的发病情况。