肾周围炎、肾周围脓肿可由多种致病菌引起，近年来由于广泛应用广谱抗生素，血运感染日趋减少，致病菌昔日以金黄色葡萄球菌为主，转为大肠埃希杆菌及变形杆菌为主，金黄色葡萄球菌次之。其他致病菌还包括许多革兰阴性杆菌，如克雷白杆菌、肠杆菌、假单胞菌和铜绿假单胞菌等。某些厌氧菌如梭状芽孢杆菌、多形杆菌和放线菌也可致病。
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