急性膀胱炎主要是由大肠埃希菌（Escherichia coli）引起的，这种细菌在所有尿路感染中占了大约70%-90%的比例。除此之外，其他一些常见的致病菌还包括克雷伯菌属、变形杆菌、葡萄球菌和肠球菌等。这些细菌通常存在于人体的肠道内，当它们通过尿道进入膀胱时，就可能引起感染。
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