泌尿系统感染的常见病原体主要包括细菌、病毒、真菌和寄生虫等，其中以细菌最为常见。常见的致病细菌有：
1. 大肠埃希氏菌（Escherichia coli）：这是引起泌尿系感染最常见的细菌，约占所有病例的70%-95%。
2. 克雷伯杆菌属（Klebsiella spp.）：包括肺炎克雷伯杆菌等，也是较为常见的致病菌之一。
3. 变形杆菌属（Proteus spp.）：如产酸变形杆菌和奇异变形杆菌等，在泌尿系感染中也有一定比例。
4. 肠球菌属（Enterococcus spp.）：包括粪肠球菌和屎肠球菌，这些细菌通常与医院内获得的感染有关。
5. 铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）：在免疫力低下患者中较为常见，是一种条件致病菌。
6. 沙门氏菌属（Salmonella spp.）、志贺氏菌属（Shigella spp.）和其他一些革兰阴性杆菌也可能导致泌尿系统感染，但相对少见。

此外，在特定情况下，如免疫功能受损的患者中，还可以见到真菌（如白色念珠菌 Candida albicans）和某些病毒（如巨细胞病毒 CMV、单纯疱疹病毒 HSV 等）引起的泌尿系感染。寄生虫感染较为罕见，但在一些地区或特殊人群中也可能成为致病因素之一。

对于临床诊断来说，了解患者的个人情况、流行病学背景以及可能存在的风险因素是非常重要的，这有助于选择合适的检查方法和治疗方案。