应用抗菌药物目的是抗菌，前提是选用的药物需针对病原菌。理想的方法是及时收集有关的体液、分泌物，进行微生物检查和药物敏感试验，据之选择或调整抗菌药品种。

药物的最佳疗效在感染的早期，为此还需要“经验性用药”，特别对一些危重病人，不能错失时机。下列情况可供参考：①结合感染部位分析：病原菌的来源，既有外源也有内源。临床医生应熟悉身体不同部位和其邻近组织的常驻菌，例如皮肤、皮下组织的感染，因皮肤常驻菌以革兰阻性球菌居多，如链球菌、葡萄球菌等；腹腔、会阴、大腿根部感染时，常见肠道菌群，包括厌氧菌。②局部情况也可供参考：如链球菌感染，炎症反应较明显，炎症扩散快，易形成蜂窝织炎、淋巴管炎等，脓液较稀薄，有时为血性；葡萄球菌感染，化脓性反应较明显；脓液稠厚，易有灶性破坏；绿脓杆菌感染，敷料易见绿染，与坏死组织共存时有霉腥味；厌氧菌感染时因蛋白分解、发酵，常有硫化氢、氨等特殊粪臭味，有些厌氧菌有产气作用而致出现表皮下气肿。③结合病情分析：病情急剧，较快发展为低温，低白细胞、低血压、休克者以革兰阴性杆菌感染居多。病情发展相对较缓，以高热为主、有转移性脓肿者，以金黄色葡萄球菌为多；病程迁延，持续发热，口腔黏膜出现霉斑，对一般抗生素治疗反应差时，应考虑真菌感染。